r
- Stan — 高速MCMCでパラメータ推定
- purrr — ループ処理やapply系関数の決定版
- Bioconductor — Genomicデータ解析ツール群
- biomaRt — プログラム的にデータ取得
- devtools — Rパッケージ作成支援
- dplyr — 高速data.frame処理
- edgeR — リードカウントから発現変動遺伝子を検出
- GenomicRanges — ゲノム上の範囲やアノテーション
- ggplot2 — きれいなグラフを簡単に合理的に
- knitr — Markdownにコード実行結果を編み込む
- parallel — 並行処理 in R
- Rcpp — RからC++を使う
- readr — 高速で柔軟なテーブル読み込み
- rgl — 3Dグラフ描画
- rtracklayer
- RプログラミングTips
- R環境設定
- R自学自習の基礎知識
- stringr — Rの文字列をまともな方法で処理する
- tidyr — シンプルなデータ変形ツール
- topGO — Bioconductor でenrichment解析