Heavy Watal
R
- Stan — 高速MCMCでパラメータ推定
- purrr — ループ処理やapply系関数の決定版
- Bioconductor — Genomicデータ解析ツール群
- RプログラミングTips
- R環境設定
- R自学自習の基礎知識
- biomaRt — プログラム的にデータ取得
- devtools — Rパッケージ作成支援
- dplyr — 高速data.frame処理
- edgeR — リードカウントから発現変動遺伝子を検出
- foreach/parallel — 並行処理 in R
- ggbio — Bioconductor データを ggplot2 的に描画
- ggplot2 — きれいなグラフを簡単に合理的に
- plyr — データ分割-関数適用-再結合を効率的に
- readr — 高速で柔軟なテーブル読み込み
- reshape2 — 柔軟なデータ変形ツール
- rgl — 3Dグラフ描画
- rtracklayer
- stringr — Rの文字列をまともな方法で処理する
- tidyr — シンプルなデータ変形ツール
- topGO — Bioconductor でenrichment解析