進化学実習 2023 牧野研 東北大学

岩嵜 航
東北大学 生命科学研究科 進化ゲノミクス分野 牧野研 特任助教
  1. 導入: データ解析の全体像。Rの基本。
  2. データの可視化、レポート作成。
  3. データ構造の処理1: 抽出、集約など。
  4. データ構造の処理2: 結合、変形など。
  5. データ内容の処理: 数値、文字列など。
  6. データ入力、データ解釈
  7. 統計モデリング1: 確率分布、尤度
  8. 統計モデリング2: 一般化線形モデル
  9. 発表会
2023-04-17 東北大学 理学部生物学科 進化学実習
https://heavywatal.github.io/slides/tohoku2023r/

最終日のお品書き

  • 13:00 ここまでのおさらい、レポートについて、など
  • 13:10 班で打ち合わせ 40分
  • 13:50 1週目(発表5分 + 質疑応答3分) x 8班
  • 15:00 休憩、雑談 20分
  • 15:20 2週目(発表5分 + 質疑応答3分) x 8班
  • 16:30 講評: 牧野能士教授
  • 解散、質疑応答

Lightning Talk (LT)

発表者として
短い持ち時間で言いたいことを言う。
うまく情報を絞って整理する必要がある。
聴衆として
自分が理解していない部分を探す。
必ず1つは質問するつもりで聞く。できれば実際にする。


🔰 レポートについては初日後半の資料を参照

🔰 最終日のレポートに書いてほしいこと追加

この講義を改善するためのコメントをひとつ以上。

  • ここがわかりにくかった。
  • ここで躓いた。
  • ここがツラすぎた。
  • ここは良かった。

褒めても貶しても加点・減点しません。
後輩たちのために、忌憚なき意見をよろしくお願いします。

この実習でやったこと

✅ 生物学研究にはデータとモデルが必須だと認識

✅ 再現可能な解析を楽にやりたい気持ちになる

✅ 必要な方法を調べ、実践する力をつける

✅ データ解析の基本に触れる

⬜ Rで困ったときに参照できるレポートが手元に残る


個々の方法は覚えなくても大丈夫!
忘れては調べ、を何度も繰り返しながら染み込ませていこう。

今はまだ完全に飲み込めなくても、 班員と協力してレポートを提出しよう。

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