Estimate MSY

est.MSY2(vpares, N = 1000, res1 = NULL, sim0 = NULL, nyear = NULL,
  pgy = 0.9, lim = 0.6, ban = 0.1, mY = 5, long.term = 20,
  Fmsy.max = 3, Fmsy.step = 0.1, thin = 1, inc = 1,
  SRtype = "L2", fm = 5, tol = NULL, AutoCor = FALSE,
  AutoCorOut = FALSE, current.resid = 0,
  future.function.name = "future.vpa1", seed = 1)

Arguments

N

stochastic計算するときの繰り返し回数

Fmsy.max

current FがFmsyに比べて小さすぎる場合、うまく収束しない場合があります。 そのときはこのオプションでFmsy.max=10とかしてください。

AutoCor

関数内部で自己相関係数を推定するか "future.vpa"を使う場合はどちらでも良い

AutoCorOut

フィットさせたあと残差の自己相関を計算する場合

current.resid

最近年何年分の自己相関を平均するか