Estimate MSY
est.MSY2(vpares, N = 1000, res1 = NULL, sim0 = NULL, nyear = NULL, pgy = 0.9, lim = 0.6, ban = 0.1, mY = 5, long.term = 20, Fmsy.max = 3, Fmsy.step = 0.1, thin = 1, inc = 1, SRtype = "L2", fm = 5, tol = NULL, AutoCor = FALSE, AutoCorOut = FALSE, current.resid = 0, future.function.name = "future.vpa1", seed = 1)
N | stochastic計算するときの繰り返し回数 |
---|---|
Fmsy.max | current FがFmsyに比べて小さすぎる場合、うまく収束しない場合があります。 そのときはこのオプションでFmsy.max=10とかしてください。 |
AutoCor | 関数内部で自己相関係数を推定するか "future.vpa"を使う場合はどちらでも良い |
AutoCorOut | フィットさせたあと残差の自己相関を計算する場合 |
current.resid | 最近年何年分の自己相関を平均するか |